بانک قرضالحسنه مهر ایران با سرمایه اولیه ۱۵ هزار میليارد ريال و با مشارکت بانکهاي دولتی در تاریخ 22 آذر سال 1386 افتتاح و با گسترش و توزيع موزون شعب خود در سراسر کشور آغاز به كار كرده است. بانك قرضالحسنه مهر ايران با صدور مجوز رسمی بانك مركزی ج.ا.ا. در تاريخ ششم شهریور سال 1387 و براساس برنامههای تدوين شده، ضمن انجام امور مربوطه به اعطای تسهيلات قرضالحسنه در ارتباط با فعاليتهای حساب قرضالحسنه جاری و بانكداری الكترونيكی اقدام ميکند.
بانک قرضالحسنه مهر ایران در بدو امر با دو هزار واحد بانکی متشکل از ۳۰۰ شعبه واگذاری از بانکهای سهامدار و ۱۷۰۰ واحد بانكي (باجه) مستقر در شعب بانكهای سهامدار شروع به كار کرد كه پس از تشكيل ساختار و سازمان اين بانك به دليل توسعه كيفيت شعب بانكی كليه شعب آن بانك به صورت مستقل شروع به كار کرد كه هماكنون با بيش از ۵۲۷ شعبه فعال به صورت Online در حال فعاليت هستند.